Il y a de cela prêt de quatre mille ans, alors que les peuples de la Terre venaient tout juste de quitter leur planète natale rendue inhabitable, la famille Balthier prit possession d'une compagnie minière qui devint rapidement l'une des plus importante de tout l'empire Humain. Très vite, plus aucune galaxie ressencée de l'univers ne pouvait se passer des services de la compagnie minière des Balthier. Les plus grands empereurs galactiques faisaient régulièrement appel à cette gigantesque entreprise afin d'extraire les minerais rares et précieux contenus sur leurs colonnies.
Mais un tel pouvoir est enviable... Et de nombreuses familles et entreprises rivales convoitèrent la place priviégiée des Balthier. IL y eut une alliance de formée, dont le seul but était le démentèlement du consorcium commercial des Balthier. De gigantesques flottes furent envoyées sur les plaques tournantes de l'empire commercial des Balthier, qui ne purent rivaliser avec une telle puissance de feu.
Rapidement, leur société géante fut anéhantie et leur monopole commercial perdu. Les dirigeants des nombreuses succursalles de la société furent ralliés de force aux empires des vainqueurs, et les membres de la famille Balthier furent traqués et exterminés. Un seul survécu au massacre : Balefar Balthier.
Bien qu'enfant à l'époque, Balefar a toujours gardé le souvenir de sa demeure familliale brûlée et pillée par les armées des ennemis de sa lignée. Et pendant 13 années, il resta dans l'ombre, seulement accompagné des quelques serviteurs et alliés des Balthier qui lui étaient restés fidèles, à préparer sa vengeance.
Aujourd'hui, Balefar à acquit assez de pouvoir pour prendre la tête d'une planète presque entièrement recouverte d'eau, Atlantis, dans un système solaire en bordure d'une lointaine galaxie. Et même loin des racines de l'ancien empire de sa famille, il compte bien ressurgir des ténèbres pour retrouver la lumière et envoyer dans le monde des morts ceux qui y ont jeté sa famille...